分子动力学模拟是一种通过模拟体系原子和分子运动轨迹研究体系微观和宏观性质的计算机模拟方法，是研究分子体系的重要手段。根据经典力学，只要给定分子体系中原子和分子之间的相互作用，就可以利用牛顿运动方程可以求解分子或原子的运动轨迹，然后使用一定的统计方法计算出系统的力学、热力学、动力学性质。
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